İşletme Mühendisliği Bölümü tarafından Sosyal Bilimler Enstitüsü ve Fen Bilimleri Enstitüsü'nde aşağıda yer alan tezli ve tezsiz yüksek lisans programları yürütülmektedir. Programlara ilişkin bilgiler aşağıda yer alan bağlantılar vasıtasıyla ilgili enstitü program sayfalarından, kayıt koşulları, program ücretleri ve başvuru şartları İTÜ SİS sitesinden öğrenilebilir.

Örgün Öğretim programları başka bir yüksek öğretim programına kayıtlı olunmadığı durumda ücretsizdir. İkinci öğretim tezsiz yüksek lisans programlarıysa program bazında değişen kredi başına ücretlere sahiptir.

Ayrıca Türkiye'nin ilk yöneticiler için işletme yüksek lisans programı olma özelliğini de taşıyan İTÜ Executive MBA (EMBA) programının özel bir sayfası da bulunmaktadır: İTÜ Executive MBA

İşletme Mühendisliği Tezli Yüksek Lisans Programı
İşletme Yüksek Lisans Programı (Birinci Öğretim - Tezli/Tezsiz)
Yöneticiler İçin İşletme Tezsiz Yüksek Lisans Programı (Executive MBA - İkinci Öğretim)
İşletme ve Teknoloji Yönetimi Tezsiz Yüksek Lisans Programı (İkinci Öğretim)
Girişimcilik ve Yenilik Yönetimi Tezsiz Yüksek Lisans Programı (İkinci Öğretim)